Área de Conhecimento: 20804008 - BIOLOGIA MOLECULAR
A Metagênomica permite a análise do genoma total de uma determinada amostra ambiental utilizando técnicas de biologia molecular e de microbiologia. Através da Metagenômica é possível acessar um grande número de genes podendo levar a descoberta de enzimas mais eficientes. Durante a prospecção de uma biblioteca metagenômica, construída a partir de amostras de solo da Floresta Atlântica paranaense, foi identificado um clone (MAF1LP090) com a capacidade de hidrolisar amido. O seqüenciamento parcial do inserto de DNA desse clone indicou a presença de um gene (LP090ORF27) que codifica para uma proteína com similaridade ao domínio catalítico de a-amilases. Este gene foi completamente seqüenciado apresentando 1875 pares de base e codifica para uma proteína de 624 aminoácidos (aa). Análise comparativa com banco de dados do NCBI mostrou que esta proteína (ORF27) apresenta 48% de identidade com uma a-amilase de Candidatus Koribacter versatilis e 44% com uma a-amilase de Acidobacterium capsulatum. Um provável peptídeo sinal com 29 aa está presente na porção N-terminal sugerindo que a proteína possa ser exportada para o meio extracelular. Análise utilizando o banco de dados Pfam também indicou que, além da presença do domínio catalítico de a-amilase, a proteína ORF27 apresenta domínio de uma ciclomaltodextrinase. As a-amilases são enzimas que realizam a hidrólise de ligações do tipo α-1,4 no amido e glicogênio, levando a liberação de glucose e maltose. A presença do domínio de ciclomaltodextrinase sugere que esta enzima também catalise a formação de ciclodextrinas contendo 6, 7 ou 8 resíduos de glucose a partir do polissacarídeo hidrolisado. Tanto as amilases quando as ciclodextrinases são enzimas de interesse biotecnológico e que apresentam diversas aplicações na indústria farmacêutica, cosméticos, alimentos e têxtil. Suporte financeiro: PIBITI/CNPq, PRONEX 2006, CNPq, Fundação Araucária, CAPES.
